Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZBP47756 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms