Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRCC3P46736 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRCC3P46736 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRCC3P46736 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms