Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDKN1BP46527 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDKN1BP46527 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms