Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKX2-1P43699 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-1P43699 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms