Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAGEA1P43355 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAGEA1P43355 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms