Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMPOP42166 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMPOP42166 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPOP42166 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPOP42166 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPOP42166 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPOP42166 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMPOP42166 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMPOP42166 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMPOP42166 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMPOP42166 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMPOP42166 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMPOP42166 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMPOP42166 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMPOP42166 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMPOP42166 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPOP42166 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPOP42166 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPOP42166 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPOP42166 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPOP42166 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPOP42166 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPOP42166 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMPOP42166 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMPOP42166 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms