Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARL1P40616 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARL1P40616 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL1P40616 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL1P40616 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARL1P40616 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARL1P40616 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL1P40616 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL1P40616 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL1P40616 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL1P40616 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms