Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PBX1P40424 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PBX1P40424 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PBX1P40424 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PBX1P40424 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PBX1P40424 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PBX1P40424 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PBX1P40424 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms