Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 YDR089WYDR089W 2610 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX8P40072 SHS1YDL225W 1656 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX8P40072 RPS24BYIL069C 408 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX8P40072 YNR042WYNR042W 429 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX8P40072 snR35snR35 204 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX8P40072 STI1YOR027W 1770 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX8P40072 GLT1YDL171C 6438 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX8P40072 ARG5,6YER069W 2592 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YDL009CYDL009C 324 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YFL032WYFL032W 321 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX8P40072 CAF130YGR134W 3369 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 MSH1YHR120W 2880 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 MNN1YER001W 2289 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YDR090CYDR090C 933 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YJL086CYJL086C 369 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 RMP1YLR145W 606 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YNL198CYNL198C 303 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 LTP1YPR073C 486 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 TOM5YPR133W-A 153 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 KIP3YGL216W 2418 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YLR177WYLR177W 1887 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 OSH6YKR003W 1347 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 TIF4631YGR162W 2859 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 MIC19YFR011C 513 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 RPL39YJL189W 156 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YAL037WYAL037W 804 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 GTT2YLL060C 702 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 GPI17YDR434W 1605 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 TRM44YPL030W 1704 nt5□□□□□ -1.61
SLX8P40072 STP2YHR006W 1626 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX8P40072 IRC2YDR112W 309 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX8P40072 ECO1YFR027W 846 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX8P40072 PAU13YHL046C 363 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX8P40072 NSG1YHR133C 876 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX8P40072 TUB2YFL037W 1374 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX8P40072 KAR9YPL269W 1935 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX8P40072 VAC14YLR386W 2643 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 PDS5YMR076C 3834 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 HBT1YDL223C 3141 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 FUI1YBL042C 1920 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 ARF2YDL137W 546 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YER038W-AYER038W-A 381 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 SMX2YFL017W-A 234 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 ARO2YGL148W 1131 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YGR053CYGR053C 852 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 RPL11BYGR085C 525 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 HHT2YNL031C 411 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 RPL11AYPR102C 525 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 UPC2YDR213W 2742 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 STE5YDR103W 2754 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX8P40072 JHD2YJR119C 2187 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX8P40072 TRX3YCR083W 384 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX8P40072 TCD1YHR003C 1290 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX8P40072 MRPL20YKR085C 588 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX8P40072 IMP4YNL075W 873 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YNL296WYNL296W 315 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX8P40072 SEC6YIL068C 2418 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX8P40072 MNN4YKL201C 3537 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX8P40072 YJR003CYJR003C 1560 nt4.96□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YDR102CYDR102C 333 nt4.96□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt4.96□□□□□ -1.62
SLX8P40072 ZEO1YOL109W 342 nt4.96□□□□□ -1.62
SLX8P40072 RIM13YMR154C 2184 nt4.96□□□□□ -1.62
SLX8P40072 PPZ1YML016C 2079 nt4.96□□□□□ -1.62
SLX8P40072 MTR10YOR160W 2919 nt4.96□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YJL132WYJL132W 2253 nt4.95□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YDL068WYDL068W 330 nt4.95□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt4.95□□□□□ -1.62
SLX8P40072 RMT2YDR465C 1239 nt4.95□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YGR069WYGR069W 336 nt4.95□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YHL026CYHL026C 948 nt4.95□□□□□ -1.62
SLX8P40072 snR36snR36 182 nt4.95□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YPS6YIR039C 1614 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 MGS1YNL218W 1764 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YBR259WYBR259W 2067 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YGR265WYGR265W 411 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 TEN1YLR010C 483 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YLR031WYLR031W 561 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 SCY1YGL083W 2415 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 EAP1YKL204W 1899 nt4.94□□□□□ -1.62
SLX8P40072 OPI6YDL096C 327 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 VAC8YEL013W 1737 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YFR054CYFR054C 579 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 RNR4YGR180C 1038 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 MVB12YGR206W 306 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 VPS29YHR012W 849 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YLR076CYLR076C 423 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 MUB1YMR100W 1863 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 MET31YPL038W 534 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 CDC15YAR019C 2925 nt4.93□□□□□ -1.62
SLX8P40072 RPL1BYGL135W 654 nt4.92□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt4.92□□□□□ -1.62
SLX8P40072 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt4.92□□□□□ -1.62
SLX8P40072 RAD14YMR201C 1116 nt4.92□□□□□ -1.62
SLX8P40072 HCH1YNL281W 462 nt4.92□□□□□ -1.62
SLX8P40072 snR10snR10 245 nt4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms