Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NUP62P37198 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NUP62P37198 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NUP62P37198 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NUP62P37198 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NUP62P37198 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NUP62P37198 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms