Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP5C1P36542 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms