Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM4P33991 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM4P33991 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCM4P33991 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCM4P33991 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCM4P33991 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCM4P33991 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCM4P33991 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCM4P33991 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms