Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFRSF8P28908 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF8P28908 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms