Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LOXP28300 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LOXP28300 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LOXP28300 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LOXP28300 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LOXP28300 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms