Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 MKL2-211ENST00000575537 618 ntTSL 55.75□□□□□ -1.493e-8■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 DNAJC24-205ENST00000526042 2192 ntTSL 1 (best)5.24□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 DNAJC24-209ENST00000529086 2745 ntTSL 25.17□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 MKL2-213ENST00000575833 486 ntTSL 34.2□□□□□ -1.743e-8■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 DNAJC24-206ENST00000526529 594 ntTSL 33.23□□□□□ -1.891e-7■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 DNAJC24-204ENST00000525511 417 ntTSL 32.81□□□□□ -1.961e-7■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 DNAJC24-208ENST00000527731 512 ntTSL 32.1□□□□□ -2.071e-7■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 WWC2-207ENST00000508614 604 ntTSL 313.11□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 36.3
PTBP1P26599 RABEP1-206ENST00000575475 2768 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.141e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.131e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.075e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 RABEP1-207ENST00000575991 551 ntTSL 414.07□□□□□ -0.161e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.261e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-211ENST00000510338 644 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.575e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.631e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 SDK1-206ENST00000476701 3113 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.631e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.655e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-204ENST00000504673 590 ntTSL 38.17□□□□□ -1.11e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-209ENST00000509842 1434 ntTSL 1 (best)8.03□□□□□ -1.121e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.231e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-210ENST00000509883 2659 ntTSL 1 (best)7.29□□□□□ -1.241e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-221ENST00000636289 2797 ntTSL 55.35□□□□□ -1.551e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.561e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.71e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-217ENST00000513258 591 ntTSL 43.79□□□□□ -1.81e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-207ENST00000507722 593 ntTSL 22.99□□□□□ -1.931e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-203ENST00000503809 578 ntTSL 42.12□□□□□ -2.071e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ZBTB38-218ENST00000513570 649 ntTSL 1 (best)2.07□□□□□ -2.081e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 ERI1-204ENST00000520332 750 ntTSL 31.72□□□□□ -2.135e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-8■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PRKAR1B-209ENST00000478198 602 ntTSL 313.64□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PRKAR1B-210ENST00000488474 617 ntTSL 310.9□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.881e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-209ENST00000451827 675 ntTSL 311.48□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.671e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-205ENST00000402863 825 ntTSL 210.88□□□□□ -0.671e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-211ENST00000542769 616 ntTSL 37.3□□□□□ -1.241e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.511e-10■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 AL031733.2-201ENST00000451992 2523 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 LRRTM4-204ENST00000409884 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 LRRTM4-202ENST00000409093 2247 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 36.2
PTBP1P26599 USP40-216ENST00000485943 568 ntTSL 46.3□□□□□ -1.46e-9■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.088e-9■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.28e-9■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.888e-9■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 AC008537.1-201ENST00000601627 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.677e-8■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 MYO18B-203ENST00000418374 6363 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 MYO18B-207ENST00000539302 7774 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 TASP1-206ENST00000480436 2302 ntTSL 513.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 TASP1-204ENST00000465381 993 ntTSL 510.33□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 GAB1-208ENST00000510615 568 ntTSL 44.2□□□□□ -1.743e-8■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 GAB1-204ENST00000507070 677 ntTSL 34.11□□□□□ -1.753e-8■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.783e-8■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 GAB1-211ENST00000512843 470 ntTSL 42.18□□□□□ -2.063e-8■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 GAB1-206ENST00000508833 577 ntTSL 42.14□□□□□ -2.073e-8■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.293e-7■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 PARG-204ENST00000610922 1487 ntTSL 212.78□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.824e-9■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 PARG-206ENST00000614063 3473 ntTSL 29.41□□□□□ -0.94e-9■■■■■ 36.1
PTBP1P26599 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.087e-10■■■■■ 36
PTBP1P26599 THEM4-202ENST00000471464 1832 ntTSL 1 (best)9.86□□□□□ -0.837e-10■■■■■ 36
PTBP1P26599 USP15-215ENST00000549523 584 ntTSL 58.34□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 36
PTBP1P26599 USP15-210ENST00000548836 579 ntTSL 33.4□□□□□ -1.873e-7■■■■■ 36
PTBP1P26599 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 36
PTBP1P26599 PVT1-201ENST00000504719 754 ntTSL 219.48■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 36
PTBP1P26599 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 36
PTBP1P26599 PVT1-204ENST00000517525 392 ntTSL 318.84■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 36
PTBP1P26599 PVT1-215ENST00000522963 568 ntTSL 49.8□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 36
PTBP1P26599 PVT1-216ENST00000523068 844 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 36
PTBP1P26599 GIGYF2-214ENST00000427233 530 ntTSL 57.6□□□□□ -1.191e-13■■■■■ 36
PTBP1P26599 GIGYF2-235ENST00000476995 766 ntTSL 56.98□□□□□ -1.291e-13■■■■■ 36
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 269.4 ms