Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HLA-DPA1P20036 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HLA-DPA1P20036 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms