Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARF4P18085 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARF4P18085 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARF4P18085 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARF4P18085 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARF4P18085 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARF4P18085 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARF4P18085 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARF4P18085 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms