Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms