Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN2P17655 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPN2P17655 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms