Protein–RNA interactions for Protein: P16118

PFKFB1, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB1P16118 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFKFB1P16118 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFKFB1P16118 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms