Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD44P16070 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD44P16070 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD44P16070 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD44P16070 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD44P16070 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD44P16070 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD44P16070 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD44P16070 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD44P16070 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms