Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MS4A1P11836 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A1P11836 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms