Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX5BP10606 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX5BP10606 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX5BP10606 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COX5BP10606 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COX5BP10606 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COX5BP10606 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX5BP10606 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX5BP10606 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX5BP10606 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX5BP10606 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX5BP10606 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX5BP10606 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX5BP10606 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COX5BP10606 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COX5BP10606 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COX5BP10606 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COX5BP10606 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms