Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGA3P0DJD8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGA3P0DJD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms