Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRGC1P0CF51 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms