Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC172P0C7W6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC172P0C7W6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms