Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACAA1P09110 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACAA1P09110 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms