Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MGPP08493 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MGPP08493 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MGPP08493 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MGPP08493 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MGPP08493 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MGPP08493 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms