Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRPRAP08240 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRPRAP08240 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms