Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOP08100 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOP08100 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOP08100 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOP08100 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOP08100 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOP08100 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOP08100 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOP08100 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms