Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRM2P04554 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PRM2P04554 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRM2P04554 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRM2P04554 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms