Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNB1P01574 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNB1P01574 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms