Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFNA1P01562 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms