Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMP1P01033 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms