Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTLL1O95922 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL1O95922 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms