Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP4K4O95819 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP4K4O95819 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms