Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX3O75364 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX3O75364 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX3O75364 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX3O75364 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX3O75364 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX3O75364 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PITX3O75364 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms