Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF3O75054 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF3O75054 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms