Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD6O60522 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TDRD6O60522 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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