Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUPR1O60356 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUPR1O60356 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms