Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNFSF14O43557 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF14O43557 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms