Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTSS1O43312 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTSS1O43312 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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MTSS1O43312 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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MTSS1O43312 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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MTSS1O43312 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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MTSS1O43312 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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MTSS1O43312 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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MTSS1O43312 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTSS1O43312 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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