Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTIFO43310 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTIFO43310 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTIFO43310 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTIFO43310 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTIFO43310 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTIFO43310 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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