Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIPA1L1O43166 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIPA1L1O43166 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms