Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F3O00716 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F3O00716 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F3O00716 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F3O00716 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F3O00716 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F3O00716 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F3O00716 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms