Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NOTOA8MTQ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms