Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE3A1L190 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms