Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G6

TRBV10-3, T-cell receptor beta variable 10-3 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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