Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP3Q9Y2W1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP3Q9Y2W1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms