Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX2IPQ9Y2D8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX2IPQ9Y2D8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms